More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7355 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  100 
 
 
322 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 
324 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  60.68 
 
 
322 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 
322 aa  319  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0875  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  49.04 
 
 
324 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5962  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0181365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  47.22 
 
 
329 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3432  quinone oxidoreductase  48.45 
 
 
320 aa  255  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  53.82 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  53.8 
 
 
332 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 
324 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.87 
 
 
324 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  43.56 
 
 
324 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.56 
 
 
324 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.03 
 
 
323 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 
327 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.15 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  42.64 
 
 
324 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  42.33 
 
 
324 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 
325 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.69 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.38 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
324 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
324 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 
322 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.4 
 
 
324 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 
323 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 
332 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 
332 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 
332 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
325 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.65 
 
 
323 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
327 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
324 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.18 
 
 
323 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 
324 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 
324 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
324 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 
324 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29460  putative quinone oxidoreductase  47.02 
 
 
324 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.56 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.78 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.48 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.04 
 
 
323 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  43.67 
 
 
324 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 
328 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.15 
 
 
322 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
324 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.92 
 
 
323 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
323 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
324 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.86 
 
 
315 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
324 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
321 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 
325 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3606  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
324 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.95 
 
 
326 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  43.17 
 
 
324 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3912  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.64 
 
 
332 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.63 
 
 
326 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3799  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.64 
 
 
332 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0978462 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
325 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.64 
 
 
327 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
331 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.14 
 
 
326 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.46 
 
 
326 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.62 
 
 
323 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
330 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
324 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  44.89 
 
 
319 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
326 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.04 
 
 
324 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2309  alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463879  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
325 aa  222  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.9 
 
 
324 aa  222  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  42.36 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2822  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.073881  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>