More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3799 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3912  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 332 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3799  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 332 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0978462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  51.38 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 		 322 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.37 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  54.07 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.43 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  54.43 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0875  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  49.54 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  48.87 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3432  quinone oxidoreductase  48.17 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  47.22 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5962  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.18 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0181365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  44.37 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  42.43 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.04 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.65 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.55 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.65 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.38 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  40.79 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.1 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.12 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.32 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  41.14 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.48 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.98 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.67 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.66 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1833  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.86 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.053429  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  41.8 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.37 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.51 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.79 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  41.52 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  39.7 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  39.7 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  39.7 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  39.7 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  39.7 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  39.7 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  37.84 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  39.88 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.35 
 
 		 260 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.45 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.36 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 		 325 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 		 327 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 324 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 324 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  43.21 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.05 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  40.36 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.3 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  43.83 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  37.76 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  42.55 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  42.55 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  36.64 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  42.55 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  42.55 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  42.55 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>