More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1609 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
318 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.78 
 
 
318 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.49 
 
 
318 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.26 
 
 
317 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  55.7 
 
 
313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  47.3 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
335 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.43 
 
 
324 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.49 
 
 
324 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.04 
 
 
327 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  42.68 
 
 
323 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.33 
 
 
328 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.25 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.12 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.77 
 
 
323 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  41.77 
 
 
331 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  41.77 
 
 
323 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  41.77 
 
 
331 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  41.77 
 
 
323 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.77 
 
 
331 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  41.77 
 
 
323 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  39.04 
 
 
328 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  40.31 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.02 
 
 
328 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  33.02 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  32.72 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  32.72 
 
 
328 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.91 
 
 
325 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.67 
 
 
326 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
328 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.37 
 
 
321 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.1 
 
 
328 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.39 
 
 
323 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.09 
 
 
322 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 
321 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  40.49 
 
 
319 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.89 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  32.41 
 
 
328 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  32.41 
 
 
328 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.45 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1718  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
344 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
325 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
327 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2922  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
340 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.614917  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  37.57 
 
 
328 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 
327 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.59 
 
 
320 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.31 
 
 
323 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
321 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
325 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  33.13 
 
 
336 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.39 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3686  alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
331 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343623  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.84 
 
 
336 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.44 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.64 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  32.84 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.53 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.72 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2465  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2427  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2472  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832355  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  36 
 
 
338 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.8 
 
 
317 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0480145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
325 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
329 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.47 
 
 
324 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.95 
 
 
320 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.83 
 
 
336 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.14 
 
 
341 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.52 
 
 
336 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.22 
 
 
336 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.45 
 
 
323 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.2 
 
 
320 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2724  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
324 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.04 
 
 
327 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 
323 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
335 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
353 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00158  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11430)  34.74 
 
 
332 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
323 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
324 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
327 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
327 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.24 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.55 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.05 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  35.74 
 
 
331 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  35.06 
 
 
324 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  33.43 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
324 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
325 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>