More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4431 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
352 aa  673    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.91 
 
 
348 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.77 
 
 
347 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.65 
 
 
343 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.69 
 
 
345 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 
351 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.05 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.87 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.35 
 
 
343 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.35 
 
 
343 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
339 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
339 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.56 
 
 
343 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
335 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.78 
 
 
311 aa  143  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  36.95 
 
 
322 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.95 
 
 
307 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3497  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.48 
 
 
345 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.157273  normal  0.487323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.15 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.83 
 
 
324 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
329 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
325 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11941  oxidoreductase fadB5  36.55 
 
 
334 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
333 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  35.22 
 
 
329 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  34.38 
 
 
325 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
308 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.2 
 
 
321 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
326 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
325 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
333 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.14 
 
 
328 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
325 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 
324 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.29 
 
 
326 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.11 
 
 
324 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 
322 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  33.84 
 
 
319 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.17 
 
 
331 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
324 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  29.57 
 
 
325 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  26.84 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.35 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  31.75 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.13 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  27.11 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.06 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.11 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  27.71 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
325 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.14 
 
 
328 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.62 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.52 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.63 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.42 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.85 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.91 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.65 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.84 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.62 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5249  quinone oxidoreductase  37.06 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
325 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.27 
 
 
332 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.56 
 
 
332 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  35.74 
 
 
323 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
333 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.31 
 
 
306 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.97 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.67 
 
 
326 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
324 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
326 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
322 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
323 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.88 
 
 
333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.5 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.81 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>