More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0288 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.46 
 
 
309 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  51.48 
 
 
309 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.95 
 
 
306 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  46.25 
 
 
307 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.96 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.88 
 
 
307 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.45 
 
 
300 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.62 
 
 
324 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  42.62 
 
 
324 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
324 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.32 
 
 
308 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.87 
 
 
305 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.72 
 
 
302 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 
304 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0914  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.34 
 
 
301 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1820  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.45 
 
 
305 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.09 
 
 
302 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.45 
 
 
310 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3171  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.36 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.13 
 
 
314 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
308 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.99 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.76 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1547  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135035  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0091  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
317 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
312 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.11 
 
 
317 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.01 
 
 
297 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.94 
 
 
319 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.02 
 
 
304 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
325 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
333 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.03 
 
 
308 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.44 
 
 
333 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
320 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
331 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24500  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.83 
 
 
312 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
316 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.03 
 
 
314 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.518551  hitchhiker  0.00083815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.86 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.91 
 
 
314 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  34.29 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.55 
 
 
333 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
339 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.65 
 
 
317 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
317 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  35.03 
 
 
323 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.23 
 
 
332 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.29 
 
 
639 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4178  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.13 
 
 
314 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.698619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
339 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.23 
 
 
332 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
317 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.55 
 
 
332 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
317 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 
328 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.13 
 
 
313 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.23 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.91 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.91 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.58 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3627  normal  0.206522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14300  putative zinc-binding oxidoreductase  34.36 
 
 
375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.98 
 
 
309 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.33 
 
 
317 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 
310 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.21 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4331  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.65 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.91 
 
 
332 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
337 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.09 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  28.57 
 
 
358 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
333 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.92 
 
 
317 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3546  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  32.29 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  44.16 
 
 
313 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.91 
 
 
333 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.91 
 
 
326 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.38 
 
 
315 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  35.14 
 
 
317 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
324 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2310  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.05 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3597  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  34.19 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>