More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6197 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  98.54 
 
 
343 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
343 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.18 
 
 
345 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
351 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
367 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.27 
 
 
367 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.35 
 
 
352 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.05 
 
 
343 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.61 
 
 
348 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
347 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.33 
 
 
310 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
343 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
339 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
322 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  32.86 
 
 
324 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.12 
 
 
320 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.97 
 
 
338 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.15 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  32.29 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.92 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
337 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.53 
 
 
314 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  33.43 
 
 
324 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37808  predicted protein  29.48 
 
 
453 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
313 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
325 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
324 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.12 
 
 
318 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
329 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  32.94 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.08 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.09 
 
 
327 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.66 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
325 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
317 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
326 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.47 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.95 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.64 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.75 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.39 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.18 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
331 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  32.09 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.14 
 
 
324 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.88 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  32.46 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.1 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
324 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.29 
 
 
318 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.05 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.15 
 
 
327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.45 
 
 
639 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
317 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
333 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
324 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
324 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.36 
 
 
330 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.91 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.52 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  32.35 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  31.87 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  32.09 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.89 
 
 
328 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.87 
 
 
328 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.64 
 
 
315 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
328 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.49 
 
 
324 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.61 
 
 
308 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.2 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>