More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00905 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  100 
 
 
374 aa  771    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  74.26 
 
 
373 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  55.73 
 
 
378 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.01 
 
 
377 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  52.43 
 
 
381 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  53.24 
 
 
380 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.24 
 
 
377 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  53.78 
 
 
378 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  53.39 
 
 
375 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  52.04 
 
 
375 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.78 
 
 
376 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  50.67 
 
 
367 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  50.4 
 
 
375 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.53 
 
 
379 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  49.59 
 
 
371 aa  361  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
342 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  32.17 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.25 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.83 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.02 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.3 
 
 
333 aa  86.3  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  25.62 
 
 
327 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  23.1 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  29.83 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.08 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.63 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.83 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  28.21 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.41 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  23.81 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.58 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.39 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.21 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.73 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.32 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.11 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  23.46 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  22.86 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  23.74 
 
 
326 aa  67  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.56 
 
 
332 aa  63.5  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 
324 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  21.91 
 
 
327 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  22.94 
 
 
325 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  26.41 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  25.97 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  23.71 
 
 
322 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.53 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.09 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.23 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.11 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.92 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  23.42 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  21.68 
 
 
325 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  23.45 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.14 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  25.21 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.45 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  26.27 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.25 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  25 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  25.37 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  28.63 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.05 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  23.05 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 
329 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01200  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  24.84 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.34 
 
 
329 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  28.74 
 
 
323 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  23.4 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.64 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.32 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.2 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25 
 
 
337 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.88 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.95 
 
 
335 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 
325 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.36 
 
 
329 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  30.68 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.68 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  22.98 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  30.68 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  20.29 
 
 
196 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  25.7 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  22.35 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  30.68 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>