More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2815 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  86.36 
 
 
377 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  87.3 
 
 
378 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
377 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  80.11 
 
 
381 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  74.07 
 
 
380 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  71.24 
 
 
378 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.24 
 
 
376 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  62.93 
 
 
375 aa  457  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  59.95 
 
 
375 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  59.95 
 
 
375 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.2 
 
 
379 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  56.52 
 
 
367 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  55.01 
 
 
374 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  57.3 
 
 
371 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.39 
 
 
373 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
342 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  29.77 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.35 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.96 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.31 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  31.34 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  24.03 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.69 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.27 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.44 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  23.73 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.29 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  23.29 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26 
 
 
330 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  27.11 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.6 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
332 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  25.52 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.26 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.73 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.07 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.79 
 
 
324 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  25.51 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  23.67 
 
 
322 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.17 
 
 
332 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  25.91 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.36 
 
 
324 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  25.9 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  24.9 
 
 
332 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  23.11 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.94 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.19 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  23.83 
 
 
5802 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.51 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4086  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.51 
 
 
325 aa  59.7  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.5 
 
 
322 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.61 
 
 
307 aa  59.7  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.55 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  27.85 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.35 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.5 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.14 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  23.9 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.09 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  23.75 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  23.75 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01200  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  29.94 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.97 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  24.14 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  25.43 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  23.11 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  27.78 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.14 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.78 
 
 
323 aa  57  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.45 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  22.87 
 
 
325 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  22.73 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  25.39 
 
 
422 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  21.93 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  23.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  23.33 
 
 
328 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  23.55 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.34 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  23.33 
 
 
328 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  24.27 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.94 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>