147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4989 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
376 aa  766    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  77.01 
 
 
378 aa  590  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  73.24 
 
 
377 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.7 
 
 
377 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  69.81 
 
 
381 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  71.97 
 
 
378 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  69.54 
 
 
380 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  62.77 
 
 
375 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  60.54 
 
 
375 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  59.46 
 
 
375 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.27 
 
 
379 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  53.78 
 
 
374 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  53.39 
 
 
367 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.24 
 
 
373 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  54.62 
 
 
371 aa  368  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
342 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.73 
 
 
338 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  28.32 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.75 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  26.07 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.21 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.64 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  26.64 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  23.61 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  23.47 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.35 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  24.89 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.2 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.39 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
327 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.05 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  24.56 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.56 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.76 
 
 
330 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  22.08 
 
 
325 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  25 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  21.65 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.99 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
322 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.48 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.93 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4086  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.99 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  25.11 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.79 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.35 
 
 
327 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  27.75 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.68 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  23.68 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  24.79 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  23.68 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00158  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11430)  24.12 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.59 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  28.25 
 
 
319 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  22.08 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.38 
 
 
325 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.55 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.32 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  24.1 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  23.6 
 
 
327 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  27.91 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  24.71 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  23.7 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  23.85 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  22.18 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.23 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  23.65 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  24.61 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.93 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.09 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
319 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.46 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  52.78 
 
 
336 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.79 
 
 
307 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.36 
 
 
341 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 
3176 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
325 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.65 
 
 
331 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  26.54 
 
 
724 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.09 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.64 
 
 
332 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.37 
 
 
327 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.45 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  24.64 
 
 
332 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.91 
 
 
332 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.21 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25 
 
 
320 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1640  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.75 
 
 
324 aa  46.2  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.140848  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.91 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.81 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  23.14 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>