275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2777 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  100 
 
 
378 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  87.3 
 
 
377 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  89.15 
 
 
377 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  76.68 
 
 
381 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  74.87 
 
 
380 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  69.71 
 
 
378 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.97 
 
 
376 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  61.99 
 
 
375 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  60.05 
 
 
375 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  59.79 
 
 
375 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.41 
 
 
379 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  53.78 
 
 
374 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  56.33 
 
 
371 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.89 
 
 
373 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
342 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  30.34 
 
 
348 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.17 
 
 
338 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.11 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  26.25 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.43 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.56 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  28.12 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  31 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.55 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.89 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  31.82 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  26.67 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.11 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.55 
 
 
327 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.11 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.67 
 
 
324 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  24.89 
 
 
326 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.76 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.11 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.23 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.01 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  24 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.7 
 
 
322 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.64 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0385  quinone oxidoreductase  23.58 
 
 
324 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.930589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  25.33 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 
319 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.21 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  24.05 
 
 
338 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  29.45 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.74 
 
 
326 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.07 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.23 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.69 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  26.03 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  25.5 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0630  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.16 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.11 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
329 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  23.79 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.63 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.84 
 
 
324 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
342 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  24.67 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.83 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.49 
 
 
329 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  22.82 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  23.74 
 
 
320 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.93 
 
 
324 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  25.94 
 
 
422 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.4 
 
 
329 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.22 
 
 
322 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  22.17 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.08 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  23.08 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.23 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  28.49 
 
 
337 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.08 
 
 
319 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  25.7 
 
 
324 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  25 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  24.02 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.01 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  29 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.33 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  23.05 
 
 
5802 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.58 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  22.57 
 
 
332 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.79 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  24.06 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.81 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.56 
 
 
323 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  27.39 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  22.4 
 
 
366 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>