More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1709 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
379 aa  773    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  62.8 
 
 
380 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  58.18 
 
 
378 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.41 
 
 
377 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.36 
 
 
377 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.27 
 
 
376 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  59.41 
 
 
378 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  54.45 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  54.23 
 
 
375 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  52.8 
 
 
375 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  53.07 
 
 
375 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  53.53 
 
 
374 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  54.74 
 
 
371 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 
367 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.36 
 
 
373 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
342 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  28.35 
 
 
348 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.92 
 
 
338 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  27.04 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.63 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  25.79 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.92 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.47 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.92 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.08 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.5 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  27.08 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.5 
 
 
324 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.5 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.08 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  28.98 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  24.68 
 
 
325 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  24.41 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.07 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.39 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.22 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  22.32 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.3 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  29.3 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.95 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  24.47 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
322 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
196 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  23.26 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00158  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11430)  26.47 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  26.36 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  21.82 
 
 
326 aa  60.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
319 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.39 
 
 
322 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.05 
 
 
334 aa  59.7  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  25.77 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.46 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  23.77 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.11 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.75 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  25 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.61 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  27.92 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.23 
 
 
331 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.6 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.5 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  24.7 
 
 
333 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.03 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  22.7 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  24.3 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.81 
 
 
327 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  25.6 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  24.42 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  24.3 
 
 
329 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.44 
 
 
332 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  25.43 
 
 
320 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
315 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  24.54 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.08 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.56 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  25.88 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.4 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.11 
 
 
322 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  23.39 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  24.7 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  23.9 
 
 
323 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  23.92 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>