More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0676 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  57.88 
 
 
381 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.52 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.1 
 
 
377 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  54.47 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  53.89 
 
 
375 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  52.82 
 
 
375 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  53.62 
 
 
375 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  52.3 
 
 
378 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  55.56 
 
 
378 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.12 
 
 
376 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  55.28 
 
 
371 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  50.67 
 
 
374 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.05 
 
 
379 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.33 
 
 
373 aa  361  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  29.31 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.09 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.92 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.5 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
325 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  29.39 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.8 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.36 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.23 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.17 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.62 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  26.72 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0013  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.47 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0388317  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.86 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.45 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.25 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.98 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.38 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.94 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  27.7 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  26.23 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.82 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0277  alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  28.93 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  30.58 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.8 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  31.05 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.47 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.98 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.9 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.41 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.57 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  26.88 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.27 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  27.17 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.76 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.59 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.82 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2822  alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.073881  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.63 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  26.76 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.95 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  26.76 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.63 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3606  quinone oxidoreductase  29.57 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.64 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.33 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.3 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  28.05 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1833  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.053429  normal  0.777331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>