More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1899 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.01 
 
 		 376 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  71.24 
 
 		 377 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.51 
 
 		 377 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  70.35 
 
 		 380 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  67.83 
 
 		 381 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  69.71 
 
 		 378 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  60.33 
 
 		 375 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  58.98 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  59.46 
 
 		 375 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.18 
 
 		 379 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  55.73 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.33 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  53.8 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.92 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  28.31 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.6 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.88 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  24.26 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.2 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  26.82 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  24.18 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.45 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.3 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  25.91 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  27.76 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.91 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.74 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  23.74 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  25.91 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01200  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  26.75 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.75 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  26.75 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.12 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.55 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.63 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.55 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.14 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.31 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  31.21 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  25.73 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  24.45 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.66 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  29.63 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  30.36 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.69 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  26.98 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.59 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.42 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  23.98 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  24.37 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.14 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.06 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0756  putative quinone oxidoreductase  28.05 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000103949  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.95 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  28.12 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.31 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  28.12 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 		 322 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2465  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  28.28 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  24.9 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  23.18 
 
 		 2534 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  25.58 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.1 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  26.13 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  29.78 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  25.89 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  23.46 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3455  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  22.96 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.63 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  26.32 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  23.81 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  26.42 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.05 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2427  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.9 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  24.05 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2472  alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.73 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  26.29 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>