257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3215 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
377 aa  760    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  89.15 
 
 
378 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  86.36 
 
 
377 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  76.53 
 
 
381 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  75.2 
 
 
380 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  70.51 
 
 
378 aa  544  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.7 
 
 
376 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  60.38 
 
 
375 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  58.98 
 
 
375 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  58.98 
 
 
375 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.41 
 
 
379 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  56.1 
 
 
367 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  57.71 
 
 
371 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  53.24 
 
 
374 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.16 
 
 
373 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
342 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  29.66 
 
 
348 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.54 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.99 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  31.73 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.1 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  29.6 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.15 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  32.13 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.65 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.03 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.7 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  26.36 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.25 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.76 
 
 
330 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.76 
 
 
330 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  24.89 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  25.37 
 
 
327 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  26.27 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  24.44 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0385  quinone oxidoreductase  23.98 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.930589  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.83 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  24.89 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.72 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.94 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.78 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4086  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.54 
 
 
325 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0013  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.2 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0388317  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.63 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  25.88 
 
 
349 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
315 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
325 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  26.32 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.83 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  25.11 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  24.21 
 
 
333 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.54 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  24.15 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.96 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.42 
 
 
324 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.12 
 
 
327 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.26 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.94 
 
 
328 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0630  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  22.95 
 
 
324 aa  53.5  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.11 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01200  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 
358 aa  53.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.67 
 
 
328 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527642  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.23 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
322 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.45 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.02 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.86 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.39 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  22.27 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  22.94 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  28.22 
 
 
324 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.75 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.64 
 
 
334 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  25.11 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.96 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  28.49 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
323 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.71 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  24.03 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.93 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  23.93 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>