More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2892 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2892  putative NADH oxidoreductase  100 
 
 
371 aa  761    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.71 
 
 
377 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2815  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.3 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2777  NADH oxidoreductase  56.33 
 
 
378 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1899  NADH oxidoreductase  53.8 
 
 
378 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0862891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0676  alcohol dehydrogenase  55.28 
 
 
367 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2484  putative NADH oxidoreductase  54.55 
 
 
381 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37613  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  49.59 
 
 
374 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1709  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.74 
 
 
379 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0908383  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4470  alcohol dehydrogenase-like protein  51.07 
 
 
380 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.904018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4989  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.62 
 
 
376 aa  362  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1612  alcohol dehydrogenase  51.36 
 
 
375 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1808  hypothetical protein  51.23 
 
 
375 aa  349  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2320  NADH oxidoreductase-like  50.41 
 
 
375 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0162041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2311  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.63 
 
 
373 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.48 
 
 
338 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  32.35 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.84 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.5 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.7 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  28.7 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  26.22 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.24 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.7 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.78 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.78 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.95 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.31 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.31 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.41 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  22.98 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  21.63 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  23.68 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.86 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  23.97 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  28.11 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.97 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.81 
 
 
333 aa  64.3  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.67 
 
 
324 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
325 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.03 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.43 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  25.51 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.23 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.18 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
327 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.48 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  22.17 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.27 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
322 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.29 
 
 
327 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.29 
 
 
329 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  24.13 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  27.85 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.11 
 
 
327 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  26.22 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  24.82 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  26.36 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.44 
 
 
322 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.18 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.08 
 
 
327 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0081  hypothetical protein  25.57 
 
 
332 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  25.76 
 
 
349 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  25.46 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.18 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2183  alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.18 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.81 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.95 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527642  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.14 
 
 
324 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  21.89 
 
 
324 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  23.77 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
322 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  26.88 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0013  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.31 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0388317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
332 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  25.59 
 
 
325 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  25.65 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.65 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.97 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>