52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0908 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  42.56 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  45.92 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.77 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  41.97 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  41.97 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.67 
 
 		 195 aa  117  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.7 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  41.97 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  39.15 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  38.95 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  37.56 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  37.04 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.32 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  34.55 
 
 		 285 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.46 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  29.76 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  37.63 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.74 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  32.49 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  35.08 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  34.55 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  34.66 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  25.16 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  38.19 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  34.68 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  32.65 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.55 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  22.93 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.95 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  27.5 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  37.7 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  36.6 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  28.25 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  34.72 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  28.35 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.46 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  34.97 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  25.48 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  25.53 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0282  uncharacterized phage protein  44.26 
 
 		 104 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  52.83 
 
 		 106 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  30.68 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1306  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  40.32 
 
 		 103 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0866  hypothetical protein  29.12 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1365  hypothetical protein  40.32 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  49.06 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1973  hypothetical protein  24.14 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3123  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.24 
 
 		 183 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>