20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0867 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  214  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  59.41 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  55.45 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0282  uncharacterized phage protein  55.88 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1365  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3984  hypothetical protein  41.18 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2484  phage protein  38.83 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  35.92 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  37.18 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.98 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.98 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3941  phage protein  30.69 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  37.7 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  33.85 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2022  phage protein  29 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1723  phage protein  30.84 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.010366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1627  uncharacterized phage protein  32.43 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4467  phage protein  30.3 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  36 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>