36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1332 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  36.45 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.32 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.18 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  37.17 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.69 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  35.15 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  32.68 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.61 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  28.12 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  30.73 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  25.7 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  24.34 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  32.8 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  30.73 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.32 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  32.68 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.1 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.61 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  26.67 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1755  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4467  phage protein  43.64 
 
 		 107 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  24.56 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.26 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  24.67 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  28.71 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  26.51 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  26.38 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  41.3 
 
 		 106 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>