28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4969 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  100 
 
 
187 aa  342  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  49.48 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  48.44 
 
 
191 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  53.12 
 
 
191 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.63 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.96 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  38.24 
 
 
189 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.69 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  36.46 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  36.04 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  33.97 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.76 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  34.25 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  37.08 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  35.12 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  35.12 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  31.33 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.57 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  28.98 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.27 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.41 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  25.32 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  24.72 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.71 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.46 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>