26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1702 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  100 
 
 		 191 aa  359  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  94.24 
 
 		 191 aa  315  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  87.43 
 
 		 191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  49.48 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  31.52 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  34.2 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.6 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.79 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.81 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  34.36 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  32.98 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  34.67 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  30.93 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  30.93 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.25 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.51 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  31.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.09 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.52 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  27.16 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  26.97 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  26.11 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  28.76 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.56 
 
 		 193 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>