26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1079 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  76.14 
 
 		 199 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  75.63 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  55.56 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  47.94 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  41.92 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  41.41 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.7 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  35.71 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.91 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  29.89 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  31.33 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  30.67 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  30.67 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  32.97 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  31.87 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.89 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.78 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  31.68 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  33.08 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  31.32 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  31.18 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  23.98 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.38 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>