37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1417 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  83.6 
 
 		 187 aa  320  6e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  60.32 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  64.02 
 
 		 189 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  62.43 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  58.73 
 
 		 186 aa  220  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  37.02 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.77 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  35.08 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  35.08 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  38.99 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  32.69 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.57 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  30.69 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.61 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  30.85 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  29.63 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  26.8 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  26.92 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  31.09 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.96 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  25.81 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.5 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  26.45 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  32.45 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  27.91 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  27.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  28.89 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.32 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  24.7 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  40.98 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  23.39 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  44 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  44 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.17 
 
 		 162 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>