44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3158 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  357  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  45.92 
 
 
187 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  41.49 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  40.21 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.97 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  36.96 
 
 
186 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  40.74 
 
 
189 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  41.21 
 
 
189 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  38.27 
 
 
188 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  38.27 
 
 
188 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  36.56 
 
 
189 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  42.71 
 
 
187 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  33.52 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.99 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  33.16 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  35 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  31.79 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  35.56 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.87 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  36.13 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.55 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  36.13 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  24.31 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  36.3 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  27.6 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  34.78 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  35.62 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  40 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  36.98 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.49 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  24.31 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.11 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  27.07 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  28 
 
 
285 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  37.7 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  29.59 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  27.4 
 
 
222 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  28.72 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.35 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5510  hypothetical protein  25.77 
 
 
183 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0866  hypothetical protein  32.12 
 
 
187 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94271 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  27.27 
 
 
160 aa  45.8  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.81 
 
 
201 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>