13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2684 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.5 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.94 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  32.7 
 
 
189 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.82 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  25.56 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  23.89 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  28.85 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  23.53 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  23.64 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  23.53 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  23.53 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.38 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>