31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6188 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  39.67 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  38.38 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.17 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.98 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.12 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.69 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.36 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  30.22 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.95 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  27.04 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  26.56 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.42 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  27.12 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  28.25 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0641  hypothetical protein  32.97 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  27.98 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1755  hypothetical protein  32.21 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  25.54 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  26.78 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  25.54 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  27.09 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.12 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  25.14 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  26.6 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  26.79 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  24.72 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  26.11 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  23.64 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>