14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2477 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  30.18 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  33.54 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.25 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  24.09 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  23.35 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  23.35 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  25.14 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  34.67 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.92 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  25.51 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.75 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  26.37 
 
 		 194 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>