25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1653 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0866  hypothetical protein  45.03 
 
 
187 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.66 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  33.88 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.61 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  28.33 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  27.65 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  30.18 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.56 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  39.74 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  24.82 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.72 
 
 
191 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  24.48 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  39.58 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.09 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  35.29 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  26.63 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  26.63 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  28.47 
 
 
285 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1621  hypothetical protein  29.51 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.409697 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  26.92 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  35.29 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  30.46 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  26.37 
 
 
222 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>