21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7146 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.55 
 
 
187 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.41 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  29.87 
 
 
190 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  33.54 
 
 
222 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  32.77 
 
 
189 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.09 
 
 
189 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  39.39 
 
 
188 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  39.39 
 
 
188 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  28 
 
 
187 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  27.39 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  25.83 
 
 
189 aa  52.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  25.83 
 
 
187 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  25.98 
 
 
186 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  29.26 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  24.4 
 
 
181 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  24.56 
 
 
190 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  39.74 
 
 
162 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  39.71 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  28.47 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>