42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1813 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  100 
 
 		 189 aa  366  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  73.02 
 
 		 189 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  68.25 
 
 		 189 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  62.43 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  61.9 
 
 		 187 aa  232  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  60.85 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  44.79 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  35.45 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  35.45 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  41.61 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  36.41 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  37.19 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.02 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  33.97 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  30.22 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  27.95 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.73 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  31.72 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  27.61 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.57 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  34.69 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  33.67 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  33.08 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  25.73 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  29.89 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  32.7 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  32.45 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  31.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.93 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  26.86 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  26.58 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  31.28 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  29.02 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  37.5 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  39.58 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.16 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  24.85 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.74 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  33.85 
 
 		 103 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.49 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5510  hypothetical protein  24.22 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0866  hypothetical protein  25.97 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>