37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4255 on replicon NC_014149
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.67 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  38.93 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  31.02 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  33.73 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  35.15 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  28.65 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  32.41 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.57 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.41 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  31.15 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  31.28 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  31.28 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  31.45 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.57 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.31 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  28.42 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  25.95 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  30.57 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  29.71 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  25.95 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  29.25 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  23.49 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.27 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  27.16 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  27.16 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  23.89 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.31 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5510  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  28.75 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  40.91 
 
 		 95 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.48 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  27.33 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3941  phage protein  50 
 
 		 99 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>