24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0652 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  357  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.41 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.32 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  29.47 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  29.61 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  28.35 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  29.32 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  26.45 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.32 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.88 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.96 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  28.42 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  27.04 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  39.74 
 
 
194 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  28.12 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  29.23 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  24.4 
 
 
285 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1973  hypothetical protein  27.22 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  36.59 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.07 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  31.43 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>