30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1667 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  38.38 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.69 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.32 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.71 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0641  hypothetical protein  37.63 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  32.11 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1755  hypothetical protein  34.53 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  31.31 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  30.16 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.37 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  31.75 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  21.43 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.24 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.32 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.16 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.32 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  21.74 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  27.66 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.27 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  23.9 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  25.62 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  25.62 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  23.12 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>