30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1717 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  38.93 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.76 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  28.22 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.12 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.61 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  27.71 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.1 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  28.14 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.8 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  25.3 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  29.87 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  26.74 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  27.91 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  26.04 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.24 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.95 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  27.65 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  28.99 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  28.48 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  25.32 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  24.52 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  26.92 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  24.26 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  26 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>