27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3969 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  30.81 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  30.81 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.68 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  29.35 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  33.88 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  29.14 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  31.72 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  26.74 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  29.79 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.71 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.91 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  27.27 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  28.48 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  29.26 
 
 		 285 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0866  hypothetical protein  26.06 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  28.03 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.59 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  30.77 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  26.46 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  25.17 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.51 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.19 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  27.53 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>