40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1172 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  83.6 
 
 		 189 aa  320  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  60.32 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  62.43 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  61.9 
 
 		 189 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  57.67 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  36.46 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.7 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  34.24 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  34.24 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  42.94 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  29.12 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  33.76 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.57 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  28.1 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  28.39 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.32 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.88 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  30.51 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  25.83 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  31.95 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  29.94 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  28.09 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  36.71 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  29.07 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.32 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  25.83 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  32.2 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.47 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  40.98 
 
 		 103 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  23.78 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  27.75 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2477  hypothetical protein  36.92 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  21.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  28.19 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  47.73 
 
 		 106 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  42 
 
 		 106 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>