26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1428 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  100 
 
 		 191 aa  359  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  94.24 
 
 		 191 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  87.43 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  48.44 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  32.61 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.85 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  34.76 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  34.2 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.08 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.28 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  32.98 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  36.31 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  32.97 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.12 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.07 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.09 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  25.62 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  32.58 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  27.51 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  28.76 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.49 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>