39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2106 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  64.55 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  58.73 
 
 		 189 aa  220  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  62.43 
 
 		 189 aa  220  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  60.85 
 
 		 189 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  57.67 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  39.25 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.04 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  32.8 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  32.8 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.96 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  35.71 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  36.46 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.32 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.45 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  27.71 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  34.76 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  35.48 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  34.36 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.1 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  26.45 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.37 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  26.78 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  32.5 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  25.81 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  27.39 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  25.98 
 
 		 285 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.38 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  34.04 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  30.12 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1306  hypothetical protein  27.92 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  27.74 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  26.63 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>