19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3393 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.95 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.5 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  29.28 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.67 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  31.72 
 
 
194 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  24.26 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.47 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.93 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  31.28 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  22.95 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.31 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  22.86 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  30.43 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.77 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  26.88 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  27.07 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  36.21 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  29.51 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>