20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7327 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.68 
 
 
190 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  28.99 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.72 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  27.09 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.22 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.16 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  31.79 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.48 
 
 
195 aa  48.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.3 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.41 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  32.74 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0641  hypothetical protein  29.24 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.21 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1290  phage protein DNA packaging protein  43.14 
 
 
94 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1755  hypothetical protein  35.56 
 
 
160 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  25.64 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>