24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1619 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  39.67 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.48 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.18 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.31 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  34.13 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  31.12 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  29.24 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  31.12 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.5 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1755  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.87 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0641  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  27.6 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  29.09 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7327  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  31.67 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  26.94 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  23.53 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  36.19 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  31.58 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>