37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1339 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  37.02 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  39.15 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  39.25 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  35.48 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  36.41 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  37.23 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  43.59 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.73 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  28.22 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  30.96 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  29.14 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  27.04 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  34.25 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1636  phiE125 gp8 hypothetical protein  30.63 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  31.54 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  30.18 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  27.1 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  27.61 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3894  hypothetical protein  27.23 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.28 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  25.83 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  28.34 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  29.23 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  36.13 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  36.29 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  25.62 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  26.94 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  33.08 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  26.97 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>