41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1980 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  100 
 
 		 189 aa  366  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  78.84 
 
 		 189 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1813  bacteriophage protein  73.02 
 
 		 189 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  64.02 
 
 		 189 aa  245  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  62.43 
 
 		 187 aa  234  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2106  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  62.43 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  41.97 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1339  hypothetical protein  37.23 
 
 		 189 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0490882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3158  phiE125 gp8 hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125823  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_004310  BR0590  hypothetical protein  33.86 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0591  hypothetical protein  33.86 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0924  hypothetical protein  34.67 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.429461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4969  phiE125 gp8 family protein  36.04 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000990308 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.15 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  32.8 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1702  phiE125 gp8 family protein  32.98 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1428  phiE125 gp8 family protein  31.82 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3969  hypothetical protein  29.79 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6188  hypothetical protein  28.12 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0381  uncharacterized phage protein, putative  23.93 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0652  phiE125 gp8 hypothetical protein  27.04 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0641014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1667  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.75 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1717  hypothetical protein  24.52 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1424  phiE125 gp8 family protein  35.11 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3393  phiE125 gp8 hypothetical protein  31.28 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  hitchhiker  0.00000000307789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  31.18 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0660  hypothetical protein  21.74 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  37.18 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7146  hypothetical protein  39.71 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2631  hypothetical protein  26.09 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0076  uncharacterized phage protein, putative  32.94 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1653  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  35.29 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1134  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.407398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2173  hypothetical protein  30.73 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2472  hypothetical protein  31.76 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  38.33 
 
 		 106 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2897  hypothetical protein  32.98 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  36.67 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2684  hypothetical protein  29.56 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1306  hypothetical protein  27.22 
 
 		 181 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1619  phiE125 gp8 hypothetical protein  23.83 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.834629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>