21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3941 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3941  phage protein  100 
 
 		 99 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4467  phage protein  44 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2484  phage protein  37.78 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  35.29 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  40.96 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1290  phage protein DNA packaging protein  37.37 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1192  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000140657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  31.37 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  30.69 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1341  hypothetical protein  48.98 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2625  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2022  phage protein  32.91 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2832  uncharacterized phage protein  30.49 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00342048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2597  phage protein DNA packaging protein  32.1 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0460  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.485788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0402  phage protein DNA packaging protein  27.38 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0674  phage protein DNA packaging protein  36.62 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1569  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1332  phiE125 gp8 hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>