21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1889 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3984  hypothetical protein  48.91 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2484  phage protein  45.26 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  45.45 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  43.43 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0282  uncharacterized phage protein  40.59 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1723  phage protein  34.74 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.010366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2022  phage protein  34.74 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1627  uncharacterized phage protein  35.23 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0402  phage protein DNA packaging protein  35.56 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3941  phage protein  40.96 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2625  hypothetical protein  35.56 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2609  uncharacterized phage protein (possible DNA packaging)  41.43 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.501602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2001  phage conserved hypothetical protein, phiE125 gp8  38.78 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4286  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.285815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1365  hypothetical protein  37.35 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2832  uncharacterized phage protein  33.33 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00342048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1290  phage protein DNA packaging protein  27.78 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1062  phiE125 gp8 hypothetical protein  43.18 
 
 		 200 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0795942 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4255  phiE125 gp8 hypothetical protein  40.91 
 
 		 195 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>