More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0431 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 664 aa  1342    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 606 aa  203  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 738 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 1350 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  41.43 
 
 		 727 aa  186  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 1070 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 925 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 946 aa  177  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1203 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 686 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  37.14 
 
 		 786 aa  173  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  43.39 
 
 		 693 aa  173  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 700 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 882 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  42.09 
 
 		 750 aa  173  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1069 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 		 676 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 893 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  40.23 
 
 		 900 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 1124 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1369 aa  170  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  37.05 
 
 		 761 aa  170  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1433 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 744 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.42 
 
 		 982 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 627 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 		 1398 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 614 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 957 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 929 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 866 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  36.96 
 
 		 914 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 812 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 781 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.21 
 
 		 606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.36 
 
 		 1179 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 1040 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  39.47 
 
 		 847 aa  165  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 833 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 767 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 1397 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.97 
 
 		 544 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 817 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 791 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1128 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1452 aa  163  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 874 aa  163  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 1309 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  39.52 
 
 		 850 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.7 
 
 		 1193 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  35.98 
 
 		 819 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1260 aa  163  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 631 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.63 
 
 		 1109 aa  163  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  36.5 
 
 		 985 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 818 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  36.76 
 
 		 691 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1267 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0538  histidine kinase  26.15 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 1054 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 1596 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  38.74 
 
 		 716 aa  161  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 1302 aa  162  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 780 aa  162  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0820  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1001 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1287 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 579 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 		 713 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 1255 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 925 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  38.37 
 
 		 984 aa  160  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 876 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.92 
 
 		 1407 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1157 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 744 aa  160  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 1204 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 950 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 718 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 818 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1765 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1287 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 993 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1027 aa  160  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.08 
 
 		 935 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 708 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1310 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 644 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  41.2 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 1792 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1055 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 758 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1055 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 895 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1350 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.363366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 737 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  36.59 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>