More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1862 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1260  FAD dependent oxidoreductase  94.21 
 
 
363 aa  649    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1862  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
363 aa  733    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2012  FAD dependent oxidoreductase  76.92 
 
 
365 aa  551  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0182  D-proline dehydrogenase  78.06 
 
 
365 aa  510  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1701  FAD dependent oxidoreductase  51.14 
 
 
373 aa  361  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00120296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1963  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 
365 aa  236  7e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1414  D-proline dehydrogenase  32.59 
 
 
368 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000836219  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.96 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  25.35 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5823  putative oxidoreductase  24.56 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  26.33 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  26.33 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.1 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  23 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67150  putative oxidoreductase  24.12 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54131  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.1 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.18 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.93 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  23.57 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  27.02 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  25.76 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  27.66 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.3 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  27.78 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.86 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.23 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.86 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.86 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  23.57 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.53 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.9 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.13 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.13 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.13 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.13 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.13 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.35 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  26.17 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.88 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  26.17 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.88 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.35 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.88 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  26.17 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.9 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.9 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.89 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  27.14 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.77 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  26.34 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 
441 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.24 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0944  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972933  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0940  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.53 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.01 
 
 
429 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0244  D-amino-acid dehydrogenase  26 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.227624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  25.85 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  25.18 
 
 
413 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.69 
 
 
428 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.58 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.45 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.45 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  24.45 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  24.45 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  24.48 
 
 
439 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.45 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.87 
 
 
382 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.26 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.35 
 
 
434 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.06 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.06 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  25.85 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  32.46 
 
 
419 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  23.28 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  25.97 
 
 
416 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0765  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.49 
 
 
428 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.82 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  23.67 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>