More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2504 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2504  CheB methylesterase  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.339936  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0793  CheB methylesterase  76.68 
 
 
194 aa  313  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2357  CheB methylesterase  73.24 
 
 
146 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.55 
 
 
1407 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  42.08 
 
 
1399 aa  147  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.9 
 
 
1408 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  37.5 
 
 
980 aa  131  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6342  CheB methylesterase  37.97 
 
 
336 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 
1027 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.7 
 
 
1138 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  37.63 
 
 
1006 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.22 
 
 
887 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.44 
 
 
993 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
1008 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.96 
 
 
1371 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  37.78 
 
 
998 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.7 
 
 
1000 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  34.25 
 
 
820 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.46 
 
 
1759 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.22 
 
 
1483 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.7 
 
 
1361 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  35.83 
 
 
868 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.99 
 
 
1453 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
1279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.37 
 
 
1418 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  37.5 
 
 
879 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  39.02 
 
 
1035 aa  110  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.36 
 
 
1380 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.24 
 
 
971 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  35.75 
 
 
432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.91 
 
 
1242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.04 
 
 
1008 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.87 
 
 
1220 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.42 
 
 
1384 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
1160 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.66 
 
 
1535 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  35.03 
 
 
1337 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.65 
 
 
1248 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  34.43 
 
 
824 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.03 
 
 
852 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 
877 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.49 
 
 
1306 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.52 
 
 
1233 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  32.28 
 
 
1200 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  35.23 
 
 
1149 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6403  CheB methylesterase  30.77 
 
 
203 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00116583  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.77 
 
 
1499 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.33 
 
 
1214 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.95 
 
 
1190 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.59 
 
 
1215 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  33.33 
 
 
197 aa  101  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.21 
 
 
1158 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.62 
 
 
1167 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.49 
 
 
1120 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  34.07 
 
 
856 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 
617 aa  99.8  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  36.51 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1344 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  32.11 
 
 
1045 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  32.56 
 
 
1170 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.33 
 
 
1698 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 
1170 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  33.16 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  31.69 
 
 
1092 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  32.6 
 
 
1618 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
1165 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5175  MCP methyltransferase, CheR-type  31.41 
 
 
823 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3639  CheB methylesterase  30.65 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619946  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.97 
 
 
1445 aa  92.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  31.52 
 
 
262 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3128  MCP methyltransferase, CheR-type  34.88 
 
 
840 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  32.6 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  29.38 
 
 
1010 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5191  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  32.8 
 
 
813 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  30.98 
 
 
837 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1840  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 
840 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  30 
 
 
204 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  30.77 
 
 
337 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  29.89 
 
 
351 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.11 
 
 
1089 aa  87.8  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  30.85 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  28.65 
 
 
327 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.27 
 
 
1274 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.65 
 
 
1348 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  31.75 
 
 
351 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4160  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.21 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  30.98 
 
 
347 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  30.89 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2649  CheB methylesterase  32.98 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115234  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  30.86 
 
 
342 aa  85.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  32.96 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  30.77 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  32.18 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.41 
 
 
1535 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  29.84 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  30 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  32.18 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.8 
 
 
1303 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.09 
 
 
1218 aa  81.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>