279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3105 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3105  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  100 
 
 
465 aa  940    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  44.16 
 
 
463 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  47.31 
 
 
448 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0215  UbiD family decarboxylase  46.87 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0437  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.1 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0291  UbiD family decarboxylase  42.33 
 
 
466 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.83 
 
 
482 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  37.76 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  42 
 
 
479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.25 
 
 
478 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  36.78 
 
 
481 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.75 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  41.37 
 
 
509 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  40.05 
 
 
594 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  38.41 
 
 
617 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  40.4 
 
 
504 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  40.98 
 
 
504 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.12 
 
 
520 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.5 
 
 
490 aa  299  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  34.43 
 
 
493 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  36.46 
 
 
485 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  35.19 
 
 
491 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.98 
 
 
507 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  36.34 
 
 
639 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  34.88 
 
 
497 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  35.52 
 
 
504 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  30.98 
 
 
480 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  34.38 
 
 
486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  34.17 
 
 
486 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0396  UbiD family decarboxylase  37.5 
 
 
463 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.12 
 
 
506 aa  264  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  31.82 
 
 
482 aa  263  6e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.61 
 
 
502 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  32.99 
 
 
502 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  37.82 
 
 
606 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.99 
 
 
521 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  33.26 
 
 
504 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  40 
 
 
621 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  32.23 
 
 
502 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  32.23 
 
 
502 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  32.37 
 
 
502 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.46 
 
 
525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.26 
 
 
525 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  35.35 
 
 
606 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  32.97 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1045  putative periplasmic protein  32.96 
 
 
602 aa  239  8e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  32.1 
 
 
488 aa  239  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.9 
 
 
490 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.79 
 
 
520 aa  237  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  34.2 
 
 
495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.97 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.07 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  32.41 
 
 
520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.39 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  33.65 
 
 
487 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.06 
 
 
522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  32.92 
 
 
488 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0770  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  31.59 
 
 
602 aa  232  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.2 
 
 
509 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  33.49 
 
 
493 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.8 
 
 
488 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
497 aa  229  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
497 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  33.49 
 
 
497 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  31.76 
 
 
487 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  33.41 
 
 
487 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
497 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
497 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  33.49 
 
 
497 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
497 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.11 
 
 
600 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.26 
 
 
497 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0773  UbiD family decarboxylase  34.59 
 
 
477 aa  227  4e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632709  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.02 
 
 
493 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  31.85 
 
 
496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.02 
 
 
493 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.02 
 
 
493 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.03 
 
 
497 aa  226  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
492 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.04 
 
 
488 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
492 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
492 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
492 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.49 
 
 
492 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.92 
 
 
488 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  30.25 
 
 
488 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  30.25 
 
 
488 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0901  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.96 
 
 
602 aa  224  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  30.88 
 
 
488 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.52 
 
 
482 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.64 
 
 
501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  30.47 
 
 
488 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  29.74 
 
 
550 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  30.41 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  30.47 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  30.41 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  30.04 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1757  UbiD family decarboxylase  33.92 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122512  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  32.86 
 
 
488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  30.41 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>