185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1824 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1824  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1610  radical SAM domain-containing protein  78.66 
 
 		 254 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0456  radical SAM domain-containing protein  71.94 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1664  radical SAM domain-containing protein  74.31 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1582  radical SAM domain-containing protein  48 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1832  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0246453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1795  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.08 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  31.78 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  31.78 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 446 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  30.71 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  33.65 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.82 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 462 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  34.19 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 		 341 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 482 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  31.48 
 
 		 482 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  26.28 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 465 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  32.35 
 
 		 479 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  26.75 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 409 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 405 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 461 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  38.1 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03880  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.14 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 		 362 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 396 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  33.02 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  30.56 
 
 		 332 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 503 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 482 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  31.73 
 
 		 471 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 		 429 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 450 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.03 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 410 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.13 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.6 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.93 
 
 		 363 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 		 393 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.27 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 482 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 460 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  34.78 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 452 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.36 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 		 412 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  31.01 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.2 
 
 		 394 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.3 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  30.15 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.36 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.49 
 
 		 353 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 401 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 401 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 401 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 486 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 323 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 		 325 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.38 
 
 		 323 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.69 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  31.5 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 460 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.4 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  32.2 
 
 		 391 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 		 335 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 		 391 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.6 
 
 		 361 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 410 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 208 aa  45.4  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.83 
 
 		 326 aa  45.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 		 414 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>