More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03443 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03443  proline/betaine transporter  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  81.72 
 
 		 495 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  71.91 
 
 		 503 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  71.91 
 
 		 503 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  70.11 
 
 		 552 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  75.29 
 
 		 488 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  71.91 
 
 		 489 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  69.66 
 
 		 489 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  71.26 
 
 		 531 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  68.54 
 
 		 489 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  68.54 
 
 		 489 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  68.54 
 
 		 489 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  68.54 
 
 		 489 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 626 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  74.07 
 
 		 491 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 495 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 495 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 628 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 495 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 495 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 534 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  76.25 
 
 		 534 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  72.62 
 
 		 527 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  71.43 
 
 		 496 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  71.43 
 
 		 496 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  72.84 
 
 		 493 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  71.43 
 
 		 495 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  56.19 
 
 		 501 aa  121  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4685  proline/betaine transporter  60.47 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  52.38 
 
 		 500 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  52.38 
 
 		 500 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  52.38 
 
 		 500 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  52.38 
 
 		 500 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.43 
 
 		 500 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  51.43 
 
 		 500 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  118  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  118  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  51.43 
 
 		 500 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  52.38 
 
 		 500 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  51.4 
 
 		 500 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  51.4 
 
 		 500 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  51.4 
 
 		 500 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  59.55 
 
 		 493 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  53.92 
 
 		 452 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2166  General substrate transporter  49.51 
 
 		 495 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.734209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 454 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  49.38 
 
 		 530 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0518  General substrate transporter  50.57 
 
 		 526 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  40.57 
 
 		 483 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  46.08 
 
 		 467 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  41.12 
 
 		 482 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 434 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  38.68 
 
 		 485 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  46.08 
 
 		 444 aa  92.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  46.23 
 
 		 481 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0223  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 464 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1065  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 502 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  44.55 
 
 		 430 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 467 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  47.73 
 
 		 454 aa  88.6  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  43.14 
 
 		 460 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  43.14 
 
 		 460 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  43.14 
 
 		 460 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  47.19 
 
 		 434 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  50 
 
 		 448 aa  84.3  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.56 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  45.05 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 452 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  41.05 
 
 		 436 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 463 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  52.17 
 
 		 435 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 444 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  46.15 
 
 		 444 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  52.17 
 
 		 435 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  52.17 
 
 		 435 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  52.17 
 
 		 435 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  52.17 
 
 		 435 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 444 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  49.32 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  43.16 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  43.16 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>